La serie parte de la idea de que la evolución humana seguiría activa,
de hecho, en una encrucijada en la que una nueva especie con grandes
poderes y capacidades estaría naciendo. Sus protagonistas son un grupo
de mutantes, personas que han adquirido superpoderes de forma natural
por cambios en su estructura genética.

El tema principal sus historias es el llamado "sueño de Xavier": la
integración de los mutantes en una sociedad humana que les teme y que
a la vez necesita su protección. Es por ello que Charles Xavier, (a
veces llamado como el Profesor X) decide reclutar a un grupo de jóvenes
mutantes y adiestrarlos en el uso de sus poderes con el doble fin de
proteger a los humanos de mutantes con malvadas intenciones y de defender
a los mutantes del miedo de los humanos. En contrapartida, otros grupos
de mutantes, siendo Magneto el principal de ellos, buscarían rebelarse
violentamente contra la humanidad.

La serie comienza con la primera aparición pública de este nuevo grupo,
que con el paso de los años se fue variando de miembros y ampliándose,
naciendo numerosos spin-off y llegando a ser uno de los ejes del
Universo Marvel.